Дата постройки последнего здания: 1717-1723   см. фотографии объектов той же эпохи

Высокая башня двухэтажного храма выстроена в 1717-1723. Верхняя четырёхстолпная Александро-Невская церковь освящена 30 авг. 1724. Лепные работы в ней выполнили Иван и Игнатий Росси, плафонную роспись - И. Н. Никитин и И. Я. Вишняков, образа написал Г. Гзель. Нижняя Благовещенская церковь освящена 25 марта 1725. Образа в "каменном" (алебастровом) иконостасе написали И. Г. Адольский, И. Н. Никитин и Д. Н. Соловьев. Резные работы делали резчики Адмиралтейства. Массивные композитные колонны поддерживали плоское перекрытие с плафоном "Имя Божие" кисти Адольского и М. Л. Негрубова. При ремонтных работах в период 1838-1841 иконостасы были заменены. Храм закрыт в 1933, при этом нижнюю церковь передали "Музею-некрополю", а верхнюю в 1935 разделили межэтажными перекрытиями. С 1948-1949, после капитального ремонта, оба этажа здания заняты экспозицией Музея городской скульптуры. Комплексная реставрация проведена в 1988-1999. 30 авг.2023 ключи от храма переданы лавре, церковь стала действующей.

В верхнем храме до переноса в 1790 в Троицкий собор покоились мощи благ. кн. Александра Невского. Под нижней церковью расположена усыпальница, где среди прочих были погребены: царица Прасковья Феодоровна, малолетние дочери Александра I, архиеп. Сильвестр (Кулябка), канцлер А. А. Безбородко, дипломат Н. И. Панин, полководец А. В. Суворов, президент Академии художеств И. И. Бецкой, генерал-фельдмаршал А. Г. Разумовский, обер-камергер И. И. Шувалов, основатель Московского университета (сохранилось около 50 захоронений).

Дата постройки последнего здания: 1820-1822   см. фотографии объектов той же эпохи

Духовский корпус, связывающий Троицкий собор с Благовещенской церковью, был построен по проекту Д. Трезини в чисто барочном стиле. 23 мая 1820 в нём митр. Михаилом была заложена домовая церковь, автором которой являлся лаврский арх. В. П. Петров. Для размещения храма с востока к корпусу был пристроен алтарь, а с запада - паперть. Освящение состоялось 18 мая 1822. Вскоре, 18 июня 1822, на хорах был освящён небольшой придел прп. Сергия Радонежского с полуциркульным иконостасом. В 1867 церковь отремонтирована и украшена росписью Р. Ф. Виноградова, а в следующем году расширена пристройкой для семейного склепа гр. Н. В. Левашова, столичного губернатора. В 1894-1895 справа от алтаря, над склепом семьи Галуновых, был пристроен небольшой придел прмц. Евдокии, освящённый 12 марта. В лавре эта церковь была закрыта последней - в сер. янв. 1936, в помещении разместилась котельная. Большинство надгробий было уничтожено. До своего закрытия, особенно в 1920-е, храм играл большую роль в православной жизни города.

В церкви, еще до её освящения, произвели в 1820-1821 несколько погребений, в том числе её основателя - митр. Михаила. Усыпальница использовалась для захоронений вплоть до нач. XX в. Всего в ней было 172 захоронения, включая нескольких столичных митрополитов, а также кн. Е. И. Кутузовой-Смоленской, вдовы полководца, гр. М. А. Милорадовича, канцлера кн. В. Л. Кочубея, гр. А. Г. Кушелева-Безбородко, кн. Е. И. Голицыной ("Ночная княгиня"), гр. Н. К. Загряжской ("Пиковая дама"), кн. Г. С. Волконского.