Скит учрежден в 1900 при одноименной церкви. Закрыт в 1920, на территории располагалась лагерная командировка, затем аэродром и учебная часть Северного флота. С конца 1950-х постройки не использовались и разрушались. Монашеская жизнь возобновилась в 2003, в 2010-х выполнены ремонтно-восстановительные работы, постройки законсервированы, руины накрыты ангарами.

С Большим Соловецким островом скит соединен дорогой по насыпной дамбе между островами.